林彻和阮东伪装成“历史研究员”，成功潜入了零维实验室。这里，联邦的秘密研究“时间闭环”正在进行，他们试图解开时间的秘密。实验室内部，他们发现联邦的“芯片控制技术”实际上是对星渊族“集体意识网络”的拙劣模仿。
林彻被迫参与实验，目睹了“平行时间线的自己”因拒绝合作而被解剖。她意识到星渊族并非灭绝，而是主动“降维”成矽藻矿，等待“继承者”重启文明。联邦的“零维计划”将导致所有时间线坍缩成“单一可控历史”（即永恒独裁）。
在实验室中，林彻用引力核心“感染”了实验室的主AI，使其觉醒为“星渊族守门人”。阮东为了掩护她，自愿被“时间武器”击中，身体碎片化存在于不同时间点，留下了“当你跃迁时，记得在第三秒想我”的遗言。
林彻带着“星渊族完整基因库”逃脱，但联邦启动了“时间肃清”——所有与零维实验室相关的人将被从历史中抹除。林彻意识到，她必须找到一种方法来对抗联邦的时间武器，保护那些无辜的人。
在逃脱过程中，林彻的手臂上的刻字开始脱落，露出下面的第二层文字：“你已被看见”。这句话让她意识到，她的行为已经被某个未知的力量所注意。她开始怀疑，这个力量是否与星渊族有关。
林彻决定利用星渊族的完整基因库进行第二次升级。她知道，这可能是她唯一的机会来对抗联邦的时间武器。在阮东留下的星图的帮助下，她找到了一个古老的星渊族遗迹，那里藏有升级所需的设备。
在遗迹中，林彻发现了星渊族留下的古老设备，这些设备能够与引力核心产生共鸣，帮助她完成升级。在升级过程中，林彻感到自己与星渊族的联系更加紧密，她开始理解星渊族的真正意图。
随着升级的完成，林彻了解到星渊族的真相。星渊族并非简单地降维成矽藻矿，而是在等待一个合适的继承者来重启他们的文明。她意识到，自己就是那个继承者。
现在，林彻拥有了对抗联邦时间武器的力量。她决定返回零维实验室，阻止联邦的计划。她知道这将是一场艰难的战斗，但她已经准备好了。
林彻站在遗迹的入口，准备踏上新的旅程。她知道，这将是一条充满挑战和危险的路。但她也知道，她不再是一个人在战斗。她是星渊族的继承者，是宇宙的孩子，她将勇敢地面对即将到来的一切。
