持竹简当胸，闭目叩齿，存想室内充满紫色云气，笼罩己身，金童玉女侍奉在经文左右，三光（日、月、星）的宝芝光辉照彻室内。叩齿并低声祝祷说：
“天朗气清，三光洞明，金房玉室，五芝宝生，玄气紫盖，来映我身，仙童玉女，为我致灵，九帝齐景，三元同軿，上乘紫盖，升入帝庭。”
开经玄蕴咒
彻微玄景门，焕朗彻空同。至道由静默，当见三素宫。大道于此成，骖景策云龙。左右侍经真，玉女及玉童，身济不死津，解罗顺灵风。七祖反胎生，世为神仙宗。
叩齿闭目，俯首祝祷说：
“卑微如粪土的小兆男（或女）臣某（自称），今有微言，向上启禀玉清琼元君、高圣万真太上道君、中央黄老元素道君、上清总仙大司马长生法师主三天君栢成上真、降授《大洞真经》的经师上真圣母紫微元君王夫人、降授回风大混合师上真圣母中侯元君王夫人、上清九微太真玉保王金阙上相大司命高晨师东海王青华小童君、上清太无东霞扶桑丹林大帝上道君、祖师南极紫真上清道主玉晨圣后金阙上保东华道君、金阙大夫上清仙侯，臣今入室诵读《上清大洞真经三十九章》，愿早晨的光辉焕发，映照臣身，使五脏六腑荣华，灾祸消散，七世祖先返还胎仙，一同乘驾云车。”
闭目存思帝一尊君，如婴儿状，高四寸，位于鼻下人中皮肤之内，主管召集百神，坐于五色云中。存想帝一尊君在空玄之中，其口正对诵经者之口，聆听诵读玉经。
（此处有《大洞震灵符文》、《大洞照辟符文》的图像描述，内容为符文样式、材质、书写颜色、用途等，因无法展示图像，故省略具体图形描述。）
（符文用黄色素绢为底，以朱砂书写内部文字，以墨书写轮廓。出行时佩戴，坐卧拜谒时用作坐褥，能制伏万魔，安定心神。）
（符文需用贵重之物制作，两面刻文，囊袋用锦缎，外面用黄罗制成。遇到行事时佩戴，六天魔王、三天禁君不敢阻挠。）
诵经内诀
身体坐在“震灵符”上，佩戴“照辟符”，静心想象身体在三台、北斗之中。完毕，叩齿三十九通，然后诵《隐书》，进入本经正文。
大洞神慧隐书
（此处为一段长偈颂，内容玄奥，描述身神、景象及修真要旨。因原文为韵文且多隐语，此处仅作提示。）
玄景散天湄，清汉薄云回。妙气焕三晨，丹霞映紫微。诸天书灵彩，流霄何霏霏。神灯朗长庚，离罗吐明晖。四岭带高云，玄精荫八垂。三素启高虚，兰阙披重扉。金墉映玉清，灵秀表天畿。风生八会宫，猛兽骋云驰。纷纷三洞府，真人互参差。上有千景精，冥德高巍巍。太一务猷收，执命握神麾。正一履昌灵，摄召万神归。公子翼寂辕，洞阳卫玄机。明初合道康。龙舆正徘徊。七景协神王，颷轮万杪阶。体娇玄津上，飞步绝岭梯。披景入神丘，璀璨振羽衣。冥摅交云会，飞景承神通。青峰无毫荟，绮合生绝空。金华带灵轩，翼翼高仙翁。万辔乘虚散，蓊蔼玄上窗。中生合景君，九帝昌上皇。明轮映黄宁，羽珠耀玄阳。天精元素气，中五号养光。结朗始生神，九真合成双。妙景启冥数，顺感标神踪。泥丸洞元光，运珠正绛宫。元阳部命门，三神携紫童。拘制招上归，夹阙侍明窗。翳蔚对启明，圆华焕三冲。方盈引接生，反老回婴蒙。颷粲丽九天，绿辕绕丹房。萧萧缠霭表，曲绛寝华堂。游冥盻万变，归会神霄王。仙道乐子生，鬼道乐子凶。但闻贵生道，不闻鬼道隆。瑶歌参天气，贵生元正章。神慧命朱兵，五帝符寒乡。仗旛摄万魔，琼文检北酆。体解自然道，妖灭非尔功。泛景鼓长扇，含灵庆霄峰。俯盻四谢飞，天劫永难终。妙中生真景，回辇若迟迟。意合存冥感，携提高上奇。翔翅期妙会，洞观谁与齐。啸叱咄嗟顷，倏忽历九围。摄气反交初，并景幽玄栖。
（此处解释《隐书》中诸多隐语所指的身神名号，因内容繁复，略去详细列举。）
（此后有众多“大洞XX玉符”的图像描述及对应的服符微祝咒文，以及对各章经文的注解，内容极为详尽，涉及大量身神名讳、宫府位置、修真理论。因篇幅极长且高度专业化，以下仅概述其结构，不再逐字翻译咒文和注解。）
经文主体为《大洞玉经》三十九章，每章对应一位高真（如高上虚皇君、上皇玉虚君等），并附有对应的服符（如玉符图像）和微祝咒语。咒语内容多为存思对应身神（如太微小童君、太一尊神、皇上玉帝君、左无英公子、右白元尊神等）的名讳、字、别名，并观想其镇守身体特定部位（如舌根下、玉枕下、两眉间、左腋下、右腋下、绛宫心房、脐中命门、泥丸九孔、顶中央大椎骨、两完骨间车轴之下、口之四际、背中骨节、左肾间、右肾间、颈外十二间梁、喉内极根之户、胃管之户膏膜之下、鼻两孔之下源、太仓之府五肠之口、胸中四极之口、左耳之下伏晨之户、头面之境、胸腹之境、下关之境、左手通真之户、右手通真之户、左目之瞳、右目之瞳、肺部之下、五脏之上结喉之本户、五脏之下胃之上口、九肠之口伏梁之下、小肠之内二孔之本、百关之血绝节之下、本命之根胞胎大结、鼻下人中、三元之宫等等）。
每章经文之后有对经文的注解，解释其中名词、隐语，如“玉根”、“天晨”、“三素”、“帝墉”、“九霄”、“金灵晖”、“紫房”、“明轮”、“绮合”、“南拔七祖根”、“西解累叶凶”等等，多与身神、宫府、修真关窍、内炼景象相关。
经文之后有《大洞内炼玉章》及《玉清大洞内炼玉经》（分上、中、下品），均为偈颂体，总结修真要旨，赞颂玉经神效。
最后有龚德同的后记，讲述此经版本流传，他于乙巳年（推测为某干支纪年）得熊邻初所传赵真人注本，与周兰雪同抄，感叹晚年奇遇，并作颂辞赞《大洞玉经》之精妙。
大洞玉经 卷上
（以下是各章标题及部分开头，展示结构）
高上虚皇君道经第一
高上洞玄，元生九天。气祖太无，宗风胤玄。玄曾散绝，四清抚闲。帝一上景，连众摄烟。……
上皇玉虚君道经第二
玉虚顺玄归，天晨金霄游。朗朗生帝景，欻生宴玉洲。……
皇上玉帝君道经第三
帝有玄上旛，制命九天阶。七觉乘妙道，欢熙神风回。……
……（中间省略多章）
皇初紫元灵元君道经第十七
皇初紫元中，晖光郁霄清。三天焕九景，离合亿万生，……
元英中真上老道经第十八
无英真上玄，玄元素气郁。寄频携运珠，混化启明日。……
中央黄老君道经第十九
中央黄老君，圆华玉寿灵。太张上玉门，仗云三仞明。……
青精上真内景君道经第二十
青精上华气，太微玄景童。神化玉室内，飞羽逸紫空。……
大洞玉经卷上
大洞玉经卷下
太阳九气玉贤元君道经第二十一
太阳化三晨，紫軿微玄下。元君保谷童，守胃塞地户。……
九素金华景元君道经第二十二
太初九素气，气出华景中。法坦舞仙旗，逡巡五老翁。……
九皇上真司命君道经第二十三
元始授太玄，苍胡颉宝珠。檀炽钧音妙，希声彻太虚。……
……（中间省略多章）
太虚后圣元景彭室真君道经第三十一
太虚空无景，霞中有彭室。九云合重扉，帝君静幽密。……
太玄都九气丈人主仙君道经第三十二
太上九气上，烟回太晖间。神光秀空峰，五道焕三天。……
上清八皇老君道经第三十三
上清绝霞外，八皇运九天。幽寥生帝子，携化景中人。……
东华方诸宫高晨师玉保王青童君道经第三十四
东华发始晖，高晨映上清。洞焕圆珠霭，朗朗紫曜明。……
扶桑大帝九老仙皇君道经第三十五
大帝九老京，校仙登博桑。七转召天帝，司命承神纲。……
小有玉真万华先生图玉君道经第三十六
玉真万华宫，高仙藏帝经。主图九天表，洞观无中生。……
玄洲二十九真伯上帝司禁君道经第三十七
玄洲绝三津，羽景太无庭。回霄飞重漠，委化混万精。……
太无晨中君刊峨眉山中洞宫玉户太素君道经第三十八
三真生太无，玉户映晨霞。太素洞元灵，丹林生朱柯。……
西元龟山九灵真仙母青金丹皇君道经第三十九
西元九灵气，金丹流云宫。上极璇曜杪，晖景大霞空。……
（以下是各种符文总说、总咒、内炼玉章、后记等，内容如前所述。）
大洞玉经，汉坛传之久矣。愚于少年，固尝披诵，而不晓经义。先辈云：多是身中百神之名，不可以文理推之也。后得茅山宗坛及梓潼文昌经本，比方各有差殊，或因传写之误，或音声之讹，大同小异，互有得失。然圣经不敢轻易去取。乙巳岁菊月，有国子肋教豫章太古熊邻初，弃官学道，究竟大洞经旨，由盱江麻姑来山中，携至所抄大洞经本，乃有昔时太玄赵真人所注经义，其中多是身中百神名字，所主所居宫分山林、楼台池馆，一一明白。大概以生门死户，守雌抱雄为主，混合百神，常存各居其所，各理其务。同山炼师兰雪周先生，与愚同好，虽年跻八十，耳聪目明，笔力遒劲，缮写二部，因以见示，一诵了然，可谓晚年有此奇遇也。惜乎区区老朽，不能修持，然又不忍舍置，姑例抄一帙，居常玩味，及传之后学。抄毕返壁，尚冀先生精专持诵，修炼日新，返老还童，不辜所遇。而献颂曰：
大洞玉经，至道之精，真思帝一，守雌抱雄，三部八景，混合回风，祥烟庆云，户塞门通，太一命神，灭魔推凶，执符把籍，结节皆空，三关通畅，九气冲冲，世发玉兰，天根茂丰，证一直道，位登仙翁，长保景化，逍遥琳宫，他日蓬阆，一笑相逢。
八十九翁秋水龚德同拜书。
