面对这样的局势，正在明治维新的日本政府，在废除国内藩镇置县后，开始对琉球下手，也想把琉球置县，以防止西方殖民者后期进一步染指琉球。
这也与甲午战争前夕，清政府里面有人要求废除李氏朝鲜王国，社里朝鲜行省有异曲同工之妙。
虽然论对琉球控制力，日本清朝和西方，自然是日本对琉球控制力最强，但琉球毕竟也是大清的藩属国，日本在废琉球王国时不得不顾忌清朝的态度。
最终牡丹社事件为日本提供很好的借口和契机。
经过牡丹社事件，愚蠢的清政府不知不觉地把自己绕了进去，事实上默认了琉球之民属于日本臣民，那么琉球国自然也是日本藩属了。
1876 年 6 月，日本政府派遣内务少丞木梨精一郎，率领警官、巡查若干人前往琉球，控制琉球的司法裁判权。
12 月 10 日，眼看亡国形势加剧，琉球王尚泰派遣姐夫向德宏林世功等，秘密前往福州。
向 德宏等于翌年四月抵达福州，即向闽浙总督何璟和福州巡抚丁日昌递交琉球王尚泰的密咨。
1877 年 6 月 24 日，何璟、丁日昌联名将此事上报总理各国事务衙门，请求由即将出任日本公使的何如璋在赴任时予以交涉。
此建议得到清政府的支持。
这里我们可以看出有事先去福州，这是明清以来的惯例，琉球每次与明清政府交往都是先登陆离他们最近的福州再去北京。
琉球与福州的关系非常密切，其官方文字是汉字，语言却类似福州话。
整个琉球国国民很多都是福建人的后裔，这期中包含了朱元璋派遣的福建三十六姓善于造船航海的技术者后裔外，还有就是历代民间移民琉球的闽人后代。
如果你有幸去琉球也就是如今的冲绳去旅游，就会有种身在福州的感觉，可以说琉球无论是传统建筑，还是墓葬，还是语言都有着浓浓的福建味。
他们传统服饰也是汉服的一种，国王祭祀，即位也用的是汉唐礼仪。
如今，在冲绳琉球王宫每天仍有大清册封琉球国王的演出。
向德宏林世功一行北上北京面见李鸿章，请求出兵远征日本，救助琉球王国。
据历史记载，向德宏林世功一行初到北京身穿明朝汉服，被北京官民看稀奇。
之后，为了救国，向德宏林世功等剃发易服穿着清朝服饰，仿申包胥哭秦庭的方式，哭诉要求清政府立马派兵解救琉球。
但清政府始终想以外交手段来解决琉球问题。
后来日本为了安抚清朝，抛出了二分琉球的方案。
即就是，日本拥有琉球群岛北群岛和中群岛，清朝拥有南群岛，如果清朝想保留琉球国， 就扶持具有琉球王室血统的向德宏为新的琉球王。
作为交换条件，中国应修改日清通商条约，允日享有最惠国待遇。
据此，清政府总理衙门大臣沈桂芬等人与日方代表进行商谈，1880 年 10 月 28 日草签了《琉球条约》及《酌加条款》，但向德宏一伙在京琉球王国官员，再三诉愿南部群岛土地贫瘠，
无法生存，万不可接受，向德宏本人也拒绝担任新国王。
绝望之下的林世功，留下遗书在北京总理衙门前自杀表示抗议。
林世功自杀后，清政府拒绝在谈判条约上签字，协商破裂。
1882 年日本驻天津领事竹添进一郎与清政府恢复琉球谈判问题，但是没有达成协议。
1894—1895 年，中日甲午战争后，中国作为战败国割让台湾、澎湖，在琉球群岛问题上就更没有发言权。
1898 年，日本强迫琉球人服兵役， 三年后，琉球最后一位国王尚泰去世，琉球王国复国无望彻底灭亡。
第二次世界大战后期，美国进攻冲绳本岛，在冲绳岛战役后期，日军指挥官牛岛满执行日本政府下达的所谓“玉碎令”，要当地驻军杀光琉球人，据不完全统计，在美军登上琉球前日军
共屠杀琉球民众 26 万余人，屠杀规模之大，仅次于南京大屠杀。
这为琉球人恨日本又添加了新内容。
二战后美国原本要把琉球归还给中国，但那时的蒋介石眼里只有陕北，没有接受美国的提议。
1972 年 5 月 15 日，美国把冲绳行政权归还给日本。
至今很多琉球人还在运作琉球独立运动，以期望脱离日本。
